Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GNB3P16520 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GNB3P16520 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GNB3P16520 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GNB3P16520 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GNB3P16520 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GNB3P16520 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GNB3P16520 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GNB3P16520 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GNB3P16520 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GNB3P16520 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GNB3P16520 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GNB3P16520 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GNB3P16520 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GNB3P16520 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GNB3P16520 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GNB3P16520 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GNB3P16520 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GNB3P16520 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GNB3P16520 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GNB3P16520 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GNB3P16520 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GNB3P16520 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GNB3P16520 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GNB3P16520 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GNB3P16520 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GNB3P16520 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GNB3P16520 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GNB3P16520 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GNB3P16520 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GNB3P16520 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GNB3P16520 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GNB3P16520 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GNB3P16520 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GNB3P16520 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GNB3P16520 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GNB3P16520 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GNB3P16520 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GNB3P16520 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GNB3P16520 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GNB3P16520 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GNB3P16520 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GNB3P16520 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GNB3P16520 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GNB3P16520 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GNB3P16520 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GNB3P16520 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GNB3P16520 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GNB3P16520 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GNB3P16520 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GNB3P16520 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GNB3P16520 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GNB3P16520 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GNB3P16520 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GNB3P16520 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GNB3P16520 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GNB3P16520 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GNB3P16520 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GNB3P16520 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GNB3P16520 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GNB3P16520 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GNB3P16520 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GNB3P16520 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GNB3P16520 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GNB3P16520 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GNB3P16520 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GNB3P16520 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GNB3P16520 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GNB3P16520 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GNB3P16520 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GNB3P16520 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GNB3P16520 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GNB3P16520 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GNB3P16520 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GNB3P16520 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GNB3P16520 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GNB3P16520 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GNB3P16520 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GNB3P16520 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GNB3P16520 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GNB3P16520 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GNB3P16520 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GNB3P16520 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GNB3P16520 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GNB3P16520 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GNB3P16520 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GNB3P16520 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GNB3P16520 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GNB3P16520 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GNB3P16520 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GNB3P16520 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GNB3P16520 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GNB3P16520 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GNB3P16520 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GNB3P16520 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GNB3P16520 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GNB3P16520 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
GNB3P16520 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GNB3P16520 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GNB3P16520 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms