Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
VEGFAP15692 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
VEGFAP15692 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
VEGFAP15692 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
VEGFAP15692 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
VEGFAP15692 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
VEGFAP15692 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
VEGFAP15692 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
VEGFAP15692 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
VEGFAP15692 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
VEGFAP15692 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
VEGFAP15692 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
VEGFAP15692 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
VEGFAP15692 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
VEGFAP15692 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
VEGFAP15692 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
VEGFAP15692 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
VEGFAP15692 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
VEGFAP15692 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
VEGFAP15692 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
VEGFAP15692 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
VEGFAP15692 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
VEGFAP15692 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
VEGFAP15692 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
VEGFAP15692 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
VEGFAP15692 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
VEGFAP15692 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
VEGFAP15692 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
VEGFAP15692 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
VEGFAP15692 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
VEGFAP15692 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
VEGFAP15692 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
VEGFAP15692 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
VEGFAP15692 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
VEGFAP15692 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
VEGFAP15692 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
VEGFAP15692 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
VEGFAP15692 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
VEGFAP15692 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
VEGFAP15692 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
VEGFAP15692 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
VEGFAP15692 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
VEGFAP15692 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
VEGFAP15692 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
VEGFAP15692 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
VEGFAP15692 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
VEGFAP15692 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
VEGFAP15692 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
VEGFAP15692 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
VEGFAP15692 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
VEGFAP15692 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
VEGFAP15692 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
VEGFAP15692 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
VEGFAP15692 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
VEGFAP15692 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
VEGFAP15692 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
VEGFAP15692 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
VEGFAP15692 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
VEGFAP15692 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
VEGFAP15692 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
VEGFAP15692 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
VEGFAP15692 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
VEGFAP15692 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
VEGFAP15692 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
VEGFAP15692 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
VEGFAP15692 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
VEGFAP15692 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
VEGFAP15692 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
VEGFAP15692 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
VEGFAP15692 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
VEGFAP15692 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
VEGFAP15692 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
VEGFAP15692 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
VEGFAP15692 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
VEGFAP15692 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
VEGFAP15692 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
VEGFAP15692 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
VEGFAP15692 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
VEGFAP15692 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
VEGFAP15692 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
VEGFAP15692 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
VEGFAP15692 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
VEGFAP15692 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
VEGFAP15692 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
VEGFAP15692 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
VEGFAP15692 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
VEGFAP15692 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
VEGFAP15692 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
VEGFAP15692 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
VEGFAP15692 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
VEGFAP15692 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
VEGFAP15692 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
VEGFAP15692 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VEGFAP15692 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VEGFAP15692 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
VEGFAP15692 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VEGFAP15692 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VEGFAP15692 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VEGFAP15692 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VEGFAP15692 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms