Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme1P15532 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme1P15532 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme1P15532 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme1P15532 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme1P15532 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme1P15532 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme1P15532 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme1P15532 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme1P15532 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme1P15532 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme1P15532 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme1P15532 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme1P15532 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme1P15532 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme1P15532 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme1P15532 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme1P15532 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme1P15532 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme1P15532 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme1P15532 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme1P15532 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme1P15532 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme1P15532 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme1P15532 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme1P15532 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme1P15532 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme1P15532 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme1P15532 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme1P15532 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme1P15532 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme1P15532 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme1P15532 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme1P15532 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme1P15532 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nme1P15532 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nme1P15532 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nme1P15532 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nme1P15532 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme1P15532 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme1P15532 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme1P15532 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme1P15532 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme1P15532 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme1P15532 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme1P15532 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme1P15532 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme1P15532 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme1P15532 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme1P15532 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme1P15532 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme1P15532 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nme1P15532 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nme1P15532 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme1P15532 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme1P15532 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme1P15532 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme1P15532 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme1P15532 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme1P15532 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme1P15532 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme1P15532 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme1P15532 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme1P15532 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme1P15532 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme1P15532 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme1P15532 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme1P15532 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme1P15532 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme1P15532 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme1P15532 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme1P15532 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme1P15532 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme1P15532 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme1P15532 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme1P15532 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme1P15532 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme1P15532 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme1P15532 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme1P15532 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme1P15532 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme1P15532 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme1P15532 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme1P15532 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme1P15532 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme1P15532 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme1P15532 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nme1P15532 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nme1P15532 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme1P15532 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms