Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
HOXD8P13378 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HOXD8P13378 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HOXD8P13378 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HOXD8P13378 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HOXD8P13378 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HOXD8P13378 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HOXD8P13378 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HOXD8P13378 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXD8P13378 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXD8P13378 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXD8P13378 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXD8P13378 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXD8P13378 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXD8P13378 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXD8P13378 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXD8P13378 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXD8P13378 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXD8P13378 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXD8P13378 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXD8P13378 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXD8P13378 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXD8P13378 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXD8P13378 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXD8P13378 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXD8P13378 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXD8P13378 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXD8P13378 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HOXD8P13378 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXD8P13378 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXD8P13378 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXD8P13378 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXD8P13378 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXD8P13378 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXD8P13378 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXD8P13378 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXD8P13378 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXD8P13378 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXD8P13378 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXD8P13378 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXD8P13378 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXD8P13378 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXD8P13378 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXD8P13378 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXD8P13378 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXD8P13378 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXD8P13378 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXD8P13378 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXD8P13378 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXD8P13378 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXD8P13378 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXD8P13378 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXD8P13378 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXD8P13378 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXD8P13378 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXD8P13378 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXD8P13378 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXD8P13378 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXD8P13378 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXD8P13378 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXD8P13378 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXD8P13378 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXD8P13378 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXD8P13378 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXD8P13378 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXD8P13378 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXD8P13378 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXD8P13378 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms