Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPRP12270 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPRP12270 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPRP12270 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPRP12270 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPRP12270 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPRP12270 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TPRP12270 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TPRP12270 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPRP12270 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPRP12270 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TPRP12270 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPRP12270 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPRP12270 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPRP12270 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TPRP12270 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TPRP12270 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TPRP12270 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPRP12270 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TPRP12270 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPRP12270 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPRP12270 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPRP12270 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPRP12270 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPRP12270 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TPRP12270 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPRP12270 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPRP12270 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPRP12270 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPRP12270 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPRP12270 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPRP12270 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPRP12270 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPRP12270 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPRP12270 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPRP12270 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TPRP12270 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPRP12270 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPRP12270 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPRP12270 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPRP12270 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPRP12270 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPRP12270 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPRP12270 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPRP12270 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPRP12270 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPRP12270 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPRP12270 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TPRP12270 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPRP12270 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPRP12270 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPRP12270 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPRP12270 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPRP12270 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPRP12270 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPRP12270 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPRP12270 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPRP12270 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPRP12270 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPRP12270 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPRP12270 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPRP12270 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPRP12270 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPRP12270 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPRP12270 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPRP12270 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPRP12270 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPRP12270 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPRP12270 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPRP12270 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPRP12270 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPRP12270 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPRP12270 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPRP12270 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TPRP12270 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPRP12270 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPRP12270 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TPRP12270 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TPRP12270 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPRP12270 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPRP12270 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPRP12270 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPRP12270 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TPRP12270 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPRP12270 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPRP12270 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPRP12270 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPRP12270 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPRP12270 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPRP12270 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPRP12270 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPRP12270 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPRP12270 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPRP12270 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPRP12270 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TPRP12270 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPRP12270 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPRP12270 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPRP12270 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPRP12270 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms