Protein–RNA interactions for Protein: P12032

Timp1, Metalloproteinase inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp1P12032 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Timp1P12032 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Timp1P12032 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Timp1P12032 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Timp1P12032 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Timp1P12032 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Timp1P12032 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Timp1P12032 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Timp1P12032 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Timp1P12032 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Timp1P12032 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Timp1P12032 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Timp1P12032 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Timp1P12032 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Timp1P12032 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Timp1P12032 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Timp1P12032 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Timp1P12032 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Timp1P12032 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Timp1P12032 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Timp1P12032 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Timp1P12032 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Timp1P12032 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Timp1P12032 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Timp1P12032 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Timp1P12032 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Timp1P12032 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Timp1P12032 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Timp1P12032 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Timp1P12032 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Timp1P12032 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Timp1P12032 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Timp1P12032 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Timp1P12032 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Timp1P12032 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Timp1P12032 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Timp1P12032 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Timp1P12032 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Timp1P12032 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Timp1P12032 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Timp1P12032 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Timp1P12032 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Timp1P12032 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Timp1P12032 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Timp1P12032 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Timp1P12032 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Timp1P12032 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Timp1P12032 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Timp1P12032 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Timp1P12032 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Timp1P12032 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Timp1P12032 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Timp1P12032 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Timp1P12032 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Timp1P12032 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Timp1P12032 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Timp1P12032 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Timp1P12032 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Timp1P12032 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Timp1P12032 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Timp1P12032 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Timp1P12032 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Timp1P12032 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Timp1P12032 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Timp1P12032 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Timp1P12032 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Timp1P12032 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Timp1P12032 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Timp1P12032 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Timp1P12032 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Timp1P12032 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Timp1P12032 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Timp1P12032 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Timp1P12032 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Timp1P12032 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Timp1P12032 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Timp1P12032 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Timp1P12032 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Timp1P12032 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Timp1P12032 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Timp1P12032 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Timp1P12032 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Timp1P12032 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Timp1P12032 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Timp1P12032 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Timp1P12032 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Timp1P12032 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Timp1P12032 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Timp1P12032 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Timp1P12032 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Timp1P12032 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Timp1P12032 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Timp1P12032 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Timp1P12032 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Timp1P12032 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Timp1P12032 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Timp1P12032 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Timp1P12032 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Timp1P12032 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Timp1P12032 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms