Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ODC1P11926 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ODC1P11926 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ODC1P11926 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ODC1P11926 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ODC1P11926 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ODC1P11926 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ODC1P11926 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ODC1P11926 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ODC1P11926 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ODC1P11926 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ODC1P11926 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ODC1P11926 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ODC1P11926 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ODC1P11926 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ODC1P11926 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ODC1P11926 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ODC1P11926 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ODC1P11926 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ODC1P11926 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ODC1P11926 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ODC1P11926 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ODC1P11926 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ODC1P11926 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ODC1P11926 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ODC1P11926 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ODC1P11926 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ODC1P11926 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ODC1P11926 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ODC1P11926 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ODC1P11926 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ODC1P11926 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ODC1P11926 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ODC1P11926 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ODC1P11926 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ODC1P11926 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ODC1P11926 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ODC1P11926 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ODC1P11926 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ODC1P11926 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ODC1P11926 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ODC1P11926 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ODC1P11926 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ODC1P11926 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ODC1P11926 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ODC1P11926 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ODC1P11926 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ODC1P11926 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ODC1P11926 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ODC1P11926 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ODC1P11926 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ODC1P11926 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ODC1P11926 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ODC1P11926 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ODC1P11926 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ODC1P11926 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ODC1P11926 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ODC1P11926 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ODC1P11926 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ODC1P11926 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ODC1P11926 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ODC1P11926 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ODC1P11926 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ODC1P11926 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ODC1P11926 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ODC1P11926 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ODC1P11926 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ODC1P11926 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ODC1P11926 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ODC1P11926 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ODC1P11926 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ODC1P11926 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ODC1P11926 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ODC1P11926 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ODC1P11926 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ODC1P11926 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ODC1P11926 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ODC1P11926 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ODC1P11926 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ODC1P11926 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ODC1P11926 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ODC1P11926 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ODC1P11926 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ODC1P11926 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ODC1P11926 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ODC1P11926 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ODC1P11926 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ODC1P11926 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ODC1P11926 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ODC1P11926 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ODC1P11926 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ODC1P11926 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ODC1P11926 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ODC1P11926 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ODC1P11926 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ODC1P11926 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ODC1P11926 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ODC1P11926 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ODC1P11926 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ODC1P11926 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms