Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DMDP11532 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DMDP11532 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DMDP11532 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DMDP11532 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DMDP11532 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DMDP11532 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DMDP11532 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DMDP11532 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DMDP11532 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DMDP11532 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DMDP11532 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DMDP11532 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DMDP11532 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DMDP11532 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DMDP11532 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DMDP11532 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DMDP11532 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DMDP11532 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DMDP11532 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DMDP11532 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DMDP11532 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DMDP11532 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DMDP11532 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DMDP11532 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DMDP11532 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DMDP11532 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DMDP11532 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DMDP11532 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DMDP11532 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DMDP11532 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DMDP11532 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DMDP11532 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DMDP11532 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DMDP11532 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DMDP11532 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DMDP11532 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DMDP11532 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DMDP11532 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DMDP11532 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DMDP11532 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DMDP11532 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DMDP11532 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DMDP11532 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DMDP11532 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DMDP11532 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DMDP11532 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DMDP11532 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DMDP11532 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DMDP11532 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DMDP11532 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DMDP11532 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DMDP11532 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DMDP11532 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DMDP11532 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DMDP11532 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DMDP11532 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DMDP11532 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DMDP11532 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DMDP11532 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DMDP11532 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DMDP11532 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DMDP11532 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DMDP11532 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DMDP11532 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DMDP11532 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DMDP11532 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DMDP11532 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DMDP11532 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DMDP11532 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DMDP11532 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DMDP11532 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DMDP11532 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DMDP11532 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
DMDP11532 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DMDP11532 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DMDP11532 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DMDP11532 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DMDP11532 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DMDP11532 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DMDP11532 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DMDP11532 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DMDP11532 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DMDP11532 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DMDP11532 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DMDP11532 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DMDP11532 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DMDP11532 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DMDP11532 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DMDP11532 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DMDP11532 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DMDP11532 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DMDP11532 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DMDP11532 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DMDP11532 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DMDP11532 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DMDP11532 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DMDP11532 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DMDP11532 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DMDP11532 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
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