Protein–RNA interactions for Protein: P11274

BCR, Breakpoint cluster region protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCRP11274 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BCRP11274 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BCRP11274 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BCRP11274 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BCRP11274 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BCRP11274 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BCRP11274 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
BCRP11274 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BCRP11274 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BCRP11274 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
BCRP11274 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
BCRP11274 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BCRP11274 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BCRP11274 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BCRP11274 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BCRP11274 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BCRP11274 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BCRP11274 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BCRP11274 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BCRP11274 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BCRP11274 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BCRP11274 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BCRP11274 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BCRP11274 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BCRP11274 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BCRP11274 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BCRP11274 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BCRP11274 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BCRP11274 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BCRP11274 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BCRP11274 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
BCRP11274 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BCRP11274 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BCRP11274 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BCRP11274 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BCRP11274 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BCRP11274 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BCRP11274 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BCRP11274 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCRP11274 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCRP11274 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCRP11274 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
BCRP11274 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCRP11274 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BCRP11274 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BCRP11274 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BCRP11274 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BCRP11274 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BCRP11274 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BCRP11274 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
BCRP11274 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BCRP11274 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCRP11274 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCRP11274 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCRP11274 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCRP11274 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCRP11274 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BCRP11274 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BCRP11274 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BCRP11274 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BCRP11274 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BCRP11274 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BCRP11274 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BCRP11274 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BCRP11274 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BCRP11274 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BCRP11274 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BCRP11274 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BCRP11274 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BCRP11274 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BCRP11274 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BCRP11274 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BCRP11274 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
BCRP11274 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BCRP11274 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BCRP11274 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BCRP11274 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCRP11274 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCRP11274 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCRP11274 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BCRP11274 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BCRP11274 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BCRP11274 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BCRP11274 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BCRP11274 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BCRP11274 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BCRP11274 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BCRP11274 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BCRP11274 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BCRP11274 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BCRP11274 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BCRP11274 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BCRP11274 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BCRP11274 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCRP11274 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
BCRP11274 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
BCRP11274 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCRP11274 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCRP11274 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCRP11274 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms