Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCF2P10911 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCF2P10911 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCF2P10911 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MCF2P10911 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCF2P10911 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCF2P10911 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCF2P10911 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCF2P10911 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCF2P10911 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MCF2P10911 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCF2P10911 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCF2P10911 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MCF2P10911 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCF2P10911 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCF2P10911 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCF2P10911 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCF2P10911 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MCF2P10911 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCF2P10911 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCF2P10911 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCF2P10911 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCF2P10911 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MCF2P10911 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCF2P10911 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCF2P10911 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MCF2P10911 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCF2P10911 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
MCF2P10911 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCF2P10911 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MCF2P10911 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCF2P10911 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCF2P10911 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCF2P10911 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCF2P10911 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCF2P10911 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCF2P10911 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCF2P10911 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCF2P10911 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCF2P10911 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCF2P10911 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCF2P10911 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCF2P10911 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCF2P10911 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCF2P10911 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCF2P10911 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCF2P10911 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCF2P10911 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCF2P10911 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCF2P10911 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCF2P10911 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCF2P10911 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCF2P10911 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCF2P10911 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCF2P10911 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCF2P10911 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCF2P10911 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCF2P10911 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCF2P10911 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCF2P10911 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCF2P10911 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCF2P10911 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MCF2P10911 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCF2P10911 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCF2P10911 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCF2P10911 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCF2P10911 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCF2P10911 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MCF2P10911 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCF2P10911 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MCF2P10911 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MCF2P10911 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MCF2P10911 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCF2P10911 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCF2P10911 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCF2P10911 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCF2P10911 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCF2P10911 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCF2P10911 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCF2P10911 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCF2P10911 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCF2P10911 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCF2P10911 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCF2P10911 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCF2P10911 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCF2P10911 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCF2P10911 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCF2P10911 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCF2P10911 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCF2P10911 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
MCF2P10911 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCF2P10911 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCF2P10911 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCF2P10911 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCF2P10911 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCF2P10911 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCF2P10911 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCF2P10911 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCF2P10911 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCF2P10911 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms