Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.3 ms