Protein–RNA interactions for Protein: P10745

RBP3, Retinol-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP3P10745 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBP3P10745 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBP3P10745 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBP3P10745 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBP3P10745 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBP3P10745 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBP3P10745 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBP3P10745 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBP3P10745 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBP3P10745 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBP3P10745 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBP3P10745 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBP3P10745 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBP3P10745 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBP3P10745 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBP3P10745 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBP3P10745 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBP3P10745 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBP3P10745 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBP3P10745 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBP3P10745 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBP3P10745 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBP3P10745 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBP3P10745 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBP3P10745 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBP3P10745 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBP3P10745 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RBP3P10745 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBP3P10745 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBP3P10745 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBP3P10745 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBP3P10745 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBP3P10745 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBP3P10745 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBP3P10745 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBP3P10745 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBP3P10745 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBP3P10745 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBP3P10745 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBP3P10745 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBP3P10745 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBP3P10745 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBP3P10745 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RBP3P10745 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RBP3P10745 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBP3P10745 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBP3P10745 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBP3P10745 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBP3P10745 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBP3P10745 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RBP3P10745 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBP3P10745 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBP3P10745 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBP3P10745 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBP3P10745 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBP3P10745 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBP3P10745 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBP3P10745 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBP3P10745 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBP3P10745 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBP3P10745 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBP3P10745 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBP3P10745 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBP3P10745 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBP3P10745 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBP3P10745 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBP3P10745 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBP3P10745 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBP3P10745 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBP3P10745 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBP3P10745 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBP3P10745 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBP3P10745 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBP3P10745 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBP3P10745 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBP3P10745 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBP3P10745 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBP3P10745 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBP3P10745 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBP3P10745 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBP3P10745 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBP3P10745 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBP3P10745 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBP3P10745 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBP3P10745 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RBP3P10745 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBP3P10745 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBP3P10745 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBP3P10745 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBP3P10745 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RBP3P10745 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RBP3P10745 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RBP3P10745 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RBP3P10745 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBP3P10745 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBP3P10745 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBP3P10745 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBP3P10745 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBP3P10745 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBP3P10745 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms