Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRFP10586 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRFP10586 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRFP10586 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRFP10586 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRFP10586 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRFP10586 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRFP10586 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRFP10586 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRFP10586 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRFP10586 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRFP10586 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRFP10586 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRFP10586 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRFP10586 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRFP10586 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRFP10586 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRFP10586 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRFP10586 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRFP10586 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRFP10586 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRFP10586 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRFP10586 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRFP10586 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRFP10586 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRFP10586 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRFP10586 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRFP10586 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRFP10586 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPRFP10586 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPRFP10586 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRFP10586 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTPRFP10586 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRFP10586 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRFP10586 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRFP10586 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRFP10586 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRFP10586 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRFP10586 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRFP10586 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRFP10586 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRFP10586 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRFP10586 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRFP10586 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRFP10586 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRFP10586 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRFP10586 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRFP10586 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRFP10586 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRFP10586 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRFP10586 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRFP10586 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRFP10586 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRFP10586 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRFP10586 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRFP10586 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRFP10586 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRFP10586 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRFP10586 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRFP10586 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRFP10586 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms