Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnmt3cP0DOY1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnmt3cP0DOY1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnmt3cP0DOY1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnmt3cP0DOY1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnmt3cP0DOY1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnmt3cP0DOY1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnmt3cP0DOY1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnmt3cP0DOY1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnmt3cP0DOY1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnmt3cP0DOY1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnmt3cP0DOY1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnmt3cP0DOY1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnmt3cP0DOY1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnmt3cP0DOY1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dnmt3cP0DOY1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnmt3cP0DOY1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnmt3cP0DOY1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnmt3cP0DOY1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnmt3cP0DOY1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnmt3cP0DOY1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnmt3cP0DOY1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnmt3cP0DOY1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnmt3cP0DOY1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnmt3cP0DOY1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnmt3cP0DOY1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnmt3cP0DOY1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnmt3cP0DOY1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnmt3cP0DOY1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnmt3cP0DOY1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnmt3cP0DOY1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnmt3cP0DOY1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnmt3cP0DOY1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnmt3cP0DOY1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnmt3cP0DOY1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnmt3cP0DOY1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnmt3cP0DOY1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnmt3cP0DOY1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnmt3cP0DOY1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnmt3cP0DOY1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnmt3cP0DOY1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnmt3cP0DOY1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnmt3cP0DOY1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnmt3cP0DOY1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnmt3cP0DOY1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnmt3cP0DOY1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnmt3cP0DOY1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnmt3cP0DOY1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnmt3cP0DOY1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnmt3cP0DOY1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnmt3cP0DOY1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnmt3cP0DOY1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt3cP0DOY1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnmt3cP0DOY1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms