Protein–RNA interactions for Protein: P0DME0

SETSIP, Protein SETSIP, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETSIPP0DME0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SETSIPP0DME0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SETSIPP0DME0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SETSIPP0DME0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SETSIPP0DME0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SETSIPP0DME0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SETSIPP0DME0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SETSIPP0DME0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SETSIPP0DME0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SETSIPP0DME0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SETSIPP0DME0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SETSIPP0DME0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SETSIPP0DME0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SETSIPP0DME0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SETSIPP0DME0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SETSIPP0DME0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SETSIPP0DME0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SETSIPP0DME0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SETSIPP0DME0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SETSIPP0DME0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SETSIPP0DME0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SETSIPP0DME0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SETSIPP0DME0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SETSIPP0DME0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26■■□□□ 1.75
SETSIPP0DME0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETSIPP0DME0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETSIPP0DME0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETSIPP0DME0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETSIPP0DME0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETSIPP0DME0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SETSIPP0DME0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SETSIPP0DME0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SETSIPP0DME0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SETSIPP0DME0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SETSIPP0DME0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SETSIPP0DME0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SETSIPP0DME0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SETSIPP0DME0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SETSIPP0DME0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SETSIPP0DME0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SETSIPP0DME0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SETSIPP0DME0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SETSIPP0DME0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SETSIPP0DME0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SETSIPP0DME0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SETSIPP0DME0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SETSIPP0DME0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SETSIPP0DME0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SETSIPP0DME0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SETSIPP0DME0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SETSIPP0DME0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SETSIPP0DME0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SETSIPP0DME0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SETSIPP0DME0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SETSIPP0DME0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SETSIPP0DME0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SETSIPP0DME0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SETSIPP0DME0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SETSIPP0DME0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SETSIPP0DME0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SETSIPP0DME0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms