Protein–RNA interactions for Protein: P0CX22

YRF1-8, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 8, yeastyeast

Predictions only

Length 1,796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-8P0CX22 YBR241CYBR241C 1467 nt9.63□□□□□ -0.87
YRF1-8P0CX22 ECM14YHR132C 1293 nt9.63□□□□□ -0.87
YRF1-8P0CX22 LYS1YIR034C 1122 nt9.63□□□□□ -0.87
YRF1-8P0CX22 ISN1YOR155C 1353 nt9.62□□□□□ -0.87
YRF1-8P0CX22 RSC9YML127W 1746 nt9.62□□□□□ -0.87
YRF1-8P0CX22 AQR1YNL065W 1761 nt9.61□□□□□ -0.87
YRF1-8P0CX22 PRS2YER099C 957 nt9.61□□□□□ -0.87
YRF1-8P0CX22 PPM2YOL141W 2088 nt9.6□□□□□ -0.87
YRF1-8P0CX22 YET3YDL072C 612 nt9.6□□□□□ -0.87
YRF1-8P0CX22 RPS5YJR123W 678 nt9.6□□□□□ -0.87
YRF1-8P0CX22 CTF19YPL018W 1110 nt9.6□□□□□ -0.87
YRF1-8P0CX22 SGF73YGL066W 1974 nt9.59□□□□□ -0.87
YRF1-8P0CX22 BUG1YDL099W 1026 nt9.59□□□□□ -0.87
YRF1-8P0CX22 DUR3YHL016C 2208 nt9.58□□□□□ -0.88
YRF1-8P0CX22 PNP1YLR209C 936 nt9.58□□□□□ -0.88
YRF1-8P0CX22 OGG1YML060W 1131 nt9.57□□□□□ -0.88
YRF1-8P0CX22 RFS1YBR052C 633 nt9.57□□□□□ -0.88
YRF1-8P0CX22 TMA46YOR091W 1038 nt9.56□□□□□ -0.88
YRF1-8P0CX22 YHR020WYHR020W 2067 nt9.56□□□□□ -0.88
YRF1-8P0CX22 HBS1YKR084C 1836 nt9.55□□□□□ -0.88
YRF1-8P0CX22 FAL1YDR021W 1200 nt9.55□□□□□ -0.88
YRF1-8P0CX22 SEC13YLR208W 894 nt9.55□□□□□ -0.88
YRF1-8P0CX22 AIM33YML087C 939 nt9.55□□□□□ -0.88
YRF1-8P0CX22 YPR127WYPR127W 1038 nt9.55□□□□□ -0.88
YRF1-8P0CX22 YPL257WYPL257W 582 nt9.55□□□□□ -0.88
YRF1-8P0CX22 RPP1YHR062C 882 nt9.54□□□□□ -0.88
YRF1-8P0CX22 RPR2YIR015W 435 nt9.54□□□□□ -0.88
YRF1-8P0CX22 ARG1YOL058W 1263 nt9.54□□□□□ -0.88
YRF1-8P0CX22 YEL023CYEL023C 2049 nt9.53□□□□□ -0.88
YRF1-8P0CX22 TRS31YDR472W 852 nt9.53□□□□□ -0.88
YRF1-8P0CX22 SSO1YPL232W 873 nt9.52□□□□□ -0.88
YRF1-8P0CX22 MRP17YKL003C 396 nt9.52□□□□□ -0.89
YRF1-8P0CX22 CRF1YDR223W 1404 nt9.51□□□□□ -0.89
YRF1-8P0CX22 PSY4YBL046W 1326 nt9.51□□□□□ -0.89
YRF1-8P0CX22 YDL119CYDL119C 924 nt9.51□□□□□ -0.89
YRF1-8P0CX22 YDL177CYDL177C 513 nt9.51□□□□□ -0.89
YRF1-8P0CX22 DAL3YIR032C 588 nt9.51□□□□□ -0.89
YRF1-8P0CX22 MDE1YJR024C 735 nt9.51□□□□□ -0.89
YRF1-8P0CX22 GTO3YMR251W 1101 nt9.51□□□□□ -0.89
YRF1-8P0CX22 JNM1YMR294W 1122 nt9.51□□□□□ -0.89
YRF1-8P0CX22 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt9.51□□□□□ -0.89
YRF1-8P0CX22 YJL045WYJL045W 1905 nt9.5□□□□□ -0.89
YRF1-8P0CX22 CDC23YHR166C 1881 nt9.5□□□□□ -0.89
YRF1-8P0CX22 STT3YGL022W 2157 nt9.5□□□□□ -0.89
YRF1-8P0CX22 FCY2YER056C 1602 nt9.5□□□□□ -0.89
YRF1-8P0CX22 GNA1YFL017C 480 nt9.5□□□□□ -0.89
YRF1-8P0CX22 YJR084WYJR084W 1272 nt9.5□□□□□ -0.89
YRF1-8P0CX22 AMD2YDR242W 1650 nt9.49□□□□□ -0.89
YRF1-8P0CX22 ATG36YJL185C 882 nt9.49□□□□□ -0.89
YRF1-8P0CX22 CAF40YNL288W 1122 nt9.49□□□□□ -0.89
YRF1-8P0CX22 ICL1YER065C 1674 nt9.48□□□□□ -0.89
YRF1-8P0CX22 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt9.46□□□□□ -0.9
YRF1-8P0CX22 YDL057WYDL057W 987 nt9.46□□□□□ -0.9
YRF1-8P0CX22 SPO7YAL009W 780 nt9.46□□□□□ -0.9
YRF1-8P0CX22 RUF23RUF23 254 nt9.45□□□□□ -0.9
YRF1-8P0CX22 YJR146WYJR146W 354 nt9.45□□□□□ -0.9
YRF1-8P0CX22 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt9.45□□□□□ -0.9
YRF1-8P0CX22 YOR041CYOR041C 432 nt9.45□□□□□ -0.9
YRF1-8P0CX22 PPT1YGR123C 1542 nt9.44□□□□□ -0.9
YRF1-8P0CX22 ADE12YNL220W 1302 nt9.43□□□□□ -0.9
YRF1-8P0CX22 COX10YPL172C 1389 nt9.43□□□□□ -0.9
YRF1-8P0CX22 YML012C-AYML012C-A 378 nt9.42□□□□□ -0.9
YRF1-8P0CX22 TUF1YOR187W 1314 nt9.42□□□□□ -0.9
YRF1-8P0CX22 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-8P0CX22 SUF16tG(GCC)C 71 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-8P0CX22 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-8P0CX22 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-8P0CX22 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-8P0CX22 SUF20tG(GCC)F1 71 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-8P0CX22 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-8P0CX22 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-8P0CX22 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-8P0CX22 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-8P0CX22 SUF23tG(GCC)J2 71 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-8P0CX22 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-8P0CX22 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-8P0CX22 SUF17tG(GCC)O2 71 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-8P0CX22 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-8P0CX22 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-8P0CX22 MIX17YMR002W 471 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-8P0CX22 RFC4YOL094C 972 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-8P0CX22 EFM4YIL064W 774 nt9.4□□□□□ -0.9
YRF1-8P0CX22 PMT7YDR307W 1989 nt9.39□□□□□ -0.91
YRF1-8P0CX22 CEM1YER061C 1329 nt9.39□□□□□ -0.91
YRF1-8P0CX22 RRP45YDR280W 918 nt9.38□□□□□ -0.91
YRF1-8P0CX22 TDP1YBR223C 1635 nt9.38□□□□□ -0.91
YRF1-8P0CX22 UGX2YDL169C 672 nt9.37□□□□□ -0.91
YRF1-8P0CX22 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt9.37□□□□□ -0.91
YRF1-8P0CX22 COX20YDR231C 618 nt9.36□□□□□ -0.91
YRF1-8P0CX22 MRPL22YNL177C 930 nt9.36□□□□□ -0.91
YRF1-8P0CX22 YLR283WYLR283W 945 nt9.35□□□□□ -0.91
YRF1-8P0CX22 QCR6YFR033C 444 nt9.35□□□□□ -0.91
YRF1-8P0CX22 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt9.35□□□□□ -0.91
YRF1-8P0CX22 VMA16YHR026W 642 nt9.34□□□□□ -0.91
YRF1-8P0CX22 RPS3YNL178W 723 nt9.34□□□□□ -0.91
YRF1-8P0CX22 MRPS5YBR251W 924 nt9.34□□□□□ -0.91
YRF1-8P0CX22 ILV1YER086W 1731 nt9.33□□□□□ -0.92
YRF1-8P0CX22 CCC2YDR270W 3015 nt9.33□□□□□ -0.92
YRF1-8P0CX22 SNO4YMR322C 714 nt9.33□□□□□ -0.92
YRF1-8P0CX22 HSP33YOR391C 714 nt9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 52.5 ms