Protein–RNA interactions for Protein: P0CX21

YRF1-5, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 5, yeastyeast

Predictions only

Length 1,796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-5P0CX21 YBR241CYBR241C 1467 nt9.63□□□□□ -0.87
YRF1-5P0CX21 ECM14YHR132C 1293 nt9.63□□□□□ -0.87
YRF1-5P0CX21 LYS1YIR034C 1122 nt9.63□□□□□ -0.87
YRF1-5P0CX21 ISN1YOR155C 1353 nt9.62□□□□□ -0.87
YRF1-5P0CX21 RSC9YML127W 1746 nt9.62□□□□□ -0.87
YRF1-5P0CX21 AQR1YNL065W 1761 nt9.61□□□□□ -0.87
YRF1-5P0CX21 PRS2YER099C 957 nt9.61□□□□□ -0.87
YRF1-5P0CX21 PPM2YOL141W 2088 nt9.6□□□□□ -0.87
YRF1-5P0CX21 YET3YDL072C 612 nt9.6□□□□□ -0.87
YRF1-5P0CX21 RPS5YJR123W 678 nt9.6□□□□□ -0.87
YRF1-5P0CX21 CTF19YPL018W 1110 nt9.6□□□□□ -0.87
YRF1-5P0CX21 SGF73YGL066W 1974 nt9.59□□□□□ -0.87
YRF1-5P0CX21 BUG1YDL099W 1026 nt9.59□□□□□ -0.87
YRF1-5P0CX21 DUR3YHL016C 2208 nt9.58□□□□□ -0.88
YRF1-5P0CX21 PNP1YLR209C 936 nt9.58□□□□□ -0.88
YRF1-5P0CX21 OGG1YML060W 1131 nt9.57□□□□□ -0.88
YRF1-5P0CX21 RFS1YBR052C 633 nt9.57□□□□□ -0.88
YRF1-5P0CX21 TMA46YOR091W 1038 nt9.56□□□□□ -0.88
YRF1-5P0CX21 YHR020WYHR020W 2067 nt9.56□□□□□ -0.88
YRF1-5P0CX21 HBS1YKR084C 1836 nt9.55□□□□□ -0.88
YRF1-5P0CX21 FAL1YDR021W 1200 nt9.55□□□□□ -0.88
YRF1-5P0CX21 SEC13YLR208W 894 nt9.55□□□□□ -0.88
YRF1-5P0CX21 AIM33YML087C 939 nt9.55□□□□□ -0.88
YRF1-5P0CX21 YPR127WYPR127W 1038 nt9.55□□□□□ -0.88
YRF1-5P0CX21 YPL257WYPL257W 582 nt9.55□□□□□ -0.88
YRF1-5P0CX21 RPP1YHR062C 882 nt9.54□□□□□ -0.88
YRF1-5P0CX21 RPR2YIR015W 435 nt9.54□□□□□ -0.88
YRF1-5P0CX21 ARG1YOL058W 1263 nt9.54□□□□□ -0.88
YRF1-5P0CX21 YEL023CYEL023C 2049 nt9.53□□□□□ -0.88
YRF1-5P0CX21 TRS31YDR472W 852 nt9.53□□□□□ -0.88
YRF1-5P0CX21 SSO1YPL232W 873 nt9.52□□□□□ -0.88
YRF1-5P0CX21 MRP17YKL003C 396 nt9.52□□□□□ -0.89
YRF1-5P0CX21 CRF1YDR223W 1404 nt9.51□□□□□ -0.89
YRF1-5P0CX21 PSY4YBL046W 1326 nt9.51□□□□□ -0.89
YRF1-5P0CX21 YDL119CYDL119C 924 nt9.51□□□□□ -0.89
YRF1-5P0CX21 YDL177CYDL177C 513 nt9.51□□□□□ -0.89
YRF1-5P0CX21 DAL3YIR032C 588 nt9.51□□□□□ -0.89
YRF1-5P0CX21 MDE1YJR024C 735 nt9.51□□□□□ -0.89
YRF1-5P0CX21 GTO3YMR251W 1101 nt9.51□□□□□ -0.89
YRF1-5P0CX21 JNM1YMR294W 1122 nt9.51□□□□□ -0.89
YRF1-5P0CX21 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt9.51□□□□□ -0.89
YRF1-5P0CX21 YJL045WYJL045W 1905 nt9.5□□□□□ -0.89
YRF1-5P0CX21 CDC23YHR166C 1881 nt9.5□□□□□ -0.89
YRF1-5P0CX21 STT3YGL022W 2157 nt9.5□□□□□ -0.89
YRF1-5P0CX21 FCY2YER056C 1602 nt9.5□□□□□ -0.89
YRF1-5P0CX21 GNA1YFL017C 480 nt9.5□□□□□ -0.89
YRF1-5P0CX21 YJR084WYJR084W 1272 nt9.5□□□□□ -0.89
YRF1-5P0CX21 AMD2YDR242W 1650 nt9.49□□□□□ -0.89
YRF1-5P0CX21 ATG36YJL185C 882 nt9.49□□□□□ -0.89
YRF1-5P0CX21 CAF40YNL288W 1122 nt9.49□□□□□ -0.89
YRF1-5P0CX21 ICL1YER065C 1674 nt9.48□□□□□ -0.89
YRF1-5P0CX21 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt9.46□□□□□ -0.9
YRF1-5P0CX21 YDL057WYDL057W 987 nt9.46□□□□□ -0.9
YRF1-5P0CX21 SPO7YAL009W 780 nt9.46□□□□□ -0.9
YRF1-5P0CX21 RUF23RUF23 254 nt9.45□□□□□ -0.9
YRF1-5P0CX21 YJR146WYJR146W 354 nt9.45□□□□□ -0.9
YRF1-5P0CX21 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt9.45□□□□□ -0.9
YRF1-5P0CX21 YOR041CYOR041C 432 nt9.45□□□□□ -0.9
YRF1-5P0CX21 PPT1YGR123C 1542 nt9.44□□□□□ -0.9
YRF1-5P0CX21 ADE12YNL220W 1302 nt9.43□□□□□ -0.9
YRF1-5P0CX21 COX10YPL172C 1389 nt9.43□□□□□ -0.9
YRF1-5P0CX21 YML012C-AYML012C-A 378 nt9.42□□□□□ -0.9
YRF1-5P0CX21 TUF1YOR187W 1314 nt9.42□□□□□ -0.9
YRF1-5P0CX21 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-5P0CX21 SUF16tG(GCC)C 71 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-5P0CX21 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-5P0CX21 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-5P0CX21 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-5P0CX21 SUF20tG(GCC)F1 71 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-5P0CX21 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-5P0CX21 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-5P0CX21 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-5P0CX21 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-5P0CX21 SUF23tG(GCC)J2 71 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-5P0CX21 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-5P0CX21 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-5P0CX21 SUF17tG(GCC)O2 71 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-5P0CX21 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-5P0CX21 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-5P0CX21 MIX17YMR002W 471 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-5P0CX21 RFC4YOL094C 972 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-5P0CX21 EFM4YIL064W 774 nt9.4□□□□□ -0.9
YRF1-5P0CX21 PMT7YDR307W 1989 nt9.39□□□□□ -0.91
YRF1-5P0CX21 CEM1YER061C 1329 nt9.39□□□□□ -0.91
YRF1-5P0CX21 RRP45YDR280W 918 nt9.38□□□□□ -0.91
YRF1-5P0CX21 TDP1YBR223C 1635 nt9.38□□□□□ -0.91
YRF1-5P0CX21 UGX2YDL169C 672 nt9.37□□□□□ -0.91
YRF1-5P0CX21 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt9.37□□□□□ -0.91
YRF1-5P0CX21 COX20YDR231C 618 nt9.36□□□□□ -0.91
YRF1-5P0CX21 MRPL22YNL177C 930 nt9.36□□□□□ -0.91
YRF1-5P0CX21 YLR283WYLR283W 945 nt9.35□□□□□ -0.91
YRF1-5P0CX21 QCR6YFR033C 444 nt9.35□□□□□ -0.91
YRF1-5P0CX21 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt9.35□□□□□ -0.91
YRF1-5P0CX21 VMA16YHR026W 642 nt9.34□□□□□ -0.91
YRF1-5P0CX21 RPS3YNL178W 723 nt9.34□□□□□ -0.91
YRF1-5P0CX21 MRPS5YBR251W 924 nt9.34□□□□□ -0.91
YRF1-5P0CX21 ILV1YER086W 1731 nt9.33□□□□□ -0.92
YRF1-5P0CX21 CCC2YDR270W 3015 nt9.33□□□□□ -0.92
YRF1-5P0CX21 SNO4YMR322C 714 nt9.33□□□□□ -0.92
YRF1-5P0CX21 HSP33YOR391C 714 nt9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 125.5 ms