Protein–RNA interactions for Protein: P0C8K7

Smim1, Small integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim1P0C8K7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim1P0C8K7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim1P0C8K7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim1P0C8K7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim1P0C8K7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim1P0C8K7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim1P0C8K7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim1P0C8K7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim1P0C8K7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim1P0C8K7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim1P0C8K7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim1P0C8K7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim1P0C8K7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim1P0C8K7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim1P0C8K7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim1P0C8K7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim1P0C8K7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim1P0C8K7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim1P0C8K7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim1P0C8K7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim1P0C8K7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim1P0C8K7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim1P0C8K7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim1P0C8K7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim1P0C8K7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim1P0C8K7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim1P0C8K7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim1P0C8K7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim1P0C8K7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim1P0C8K7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim1P0C8K7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim1P0C8K7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim1P0C8K7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim1P0C8K7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim1P0C8K7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim1P0C8K7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim1P0C8K7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim1P0C8K7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim1P0C8K7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim1P0C8K7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms