Protein–RNA interactions for Protein: P0C090

Rc3h2, Roquin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rc3h2P0C090 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rc3h2P0C090 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rc3h2P0C090 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rc3h2P0C090 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rc3h2P0C090 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rc3h2P0C090 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rc3h2P0C090 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rc3h2P0C090 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rc3h2P0C090 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rc3h2P0C090 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rc3h2P0C090 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rc3h2P0C090 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rc3h2P0C090 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rc3h2P0C090 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rc3h2P0C090 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rc3h2P0C090 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rc3h2P0C090 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rc3h2P0C090 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rc3h2P0C090 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rc3h2P0C090 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rc3h2P0C090 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rc3h2P0C090 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rc3h2P0C090 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rc3h2P0C090 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rc3h2P0C090 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rc3h2P0C090 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rc3h2P0C090 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rc3h2P0C090 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rc3h2P0C090 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rc3h2P0C090 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rc3h2P0C090 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rc3h2P0C090 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rc3h2P0C090 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rc3h2P0C090 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rc3h2P0C090 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rc3h2P0C090 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rc3h2P0C090 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rc3h2P0C090 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rc3h2P0C090 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rc3h2P0C090 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rc3h2P0C090 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rc3h2P0C090 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rc3h2P0C090 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rc3h2P0C090 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rc3h2P0C090 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rc3h2P0C090 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rc3h2P0C090 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rc3h2P0C090 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rc3h2P0C090 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rc3h2P0C090 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rc3h2P0C090 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rc3h2P0C090 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rc3h2P0C090 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rc3h2P0C090 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rc3h2P0C090 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rc3h2P0C090 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rc3h2P0C090 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rc3h2P0C090 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rc3h2P0C090 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rc3h2P0C090 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rc3h2P0C090 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rc3h2P0C090 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rc3h2P0C090 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rc3h2P0C090 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rc3h2P0C090 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rc3h2P0C090 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rc3h2P0C090 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rc3h2P0C090 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rc3h2P0C090 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rc3h2P0C090 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rc3h2P0C090 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rc3h2P0C090 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rc3h2P0C090 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rc3h2P0C090 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rc3h2P0C090 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rc3h2P0C090 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rc3h2P0C090 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rc3h2P0C090 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rc3h2P0C090 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rc3h2P0C090 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rc3h2P0C090 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rc3h2P0C090 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rc3h2P0C090 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rc3h2P0C090 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rc3h2P0C090 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rc3h2P0C090 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rc3h2P0C090 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rc3h2P0C090 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rc3h2P0C090 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rc3h2P0C090 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rc3h2P0C090 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rc3h2P0C090 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rc3h2P0C090 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rc3h2P0C090 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rc3h2P0C090 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rc3h2P0C090 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rc3h2P0C090 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rc3h2P0C090 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rc3h2P0C090 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rc3h2P0C090 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms