Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
HOXB7P09629 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
HOXB7P09629 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
HOXB7P09629 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
HOXB7P09629 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
HOXB7P09629 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
HOXB7P09629 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
HOXB7P09629 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
HOXB7P09629 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
HOXB7P09629 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.61■■■□□ 2.65
HOXB7P09629 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
HOXB7P09629 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
HOXB7P09629 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
HOXB7P09629 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
HOXB7P09629 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
HOXB7P09629 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
HOXB7P09629 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
HOXB7P09629 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
HOXB7P09629 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
HOXB7P09629 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.65
HOXB7P09629 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
HOXB7P09629 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
HOXB7P09629 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
HOXB7P09629 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
HOXB7P09629 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
HOXB7P09629 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
HOXB7P09629 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
HOXB7P09629 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
HOXB7P09629 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
HOXB7P09629 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
HOXB7P09629 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC31.54■■■□□ 2.64
HOXB7P09629 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
HOXB7P09629 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
HOXB7P09629 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
HOXB7P09629 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
HOXB7P09629 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
HOXB7P09629 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
HOXB7P09629 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
HOXB7P09629 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
HOXB7P09629 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
HOXB7P09629 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
HOXB7P09629 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
HOXB7P09629 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
HOXB7P09629 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
HOXB7P09629 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
HOXB7P09629 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
HOXB7P09629 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
HOXB7P09629 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
HOXB7P09629 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
HOXB7P09629 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
HOXB7P09629 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
HOXB7P09629 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
HOXB7P09629 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
HOXB7P09629 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
HOXB7P09629 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
HOXB7P09629 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
HOXB7P09629 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
HOXB7P09629 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
HOXB7P09629 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
HOXB7P09629 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
HOXB7P09629 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
HOXB7P09629 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
HOXB7P09629 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
HOXB7P09629 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
HOXB7P09629 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
HOXB7P09629 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
HOXB7P09629 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
HOXB7P09629 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
HOXB7P09629 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
HOXB7P09629 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
HOXB7P09629 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
HOXB7P09629 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
HOXB7P09629 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
HOXB7P09629 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
HOXB7P09629 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
HOXB7P09629 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
HOXB7P09629 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
HOXB7P09629 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
HOXB7P09629 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
HOXB7P09629 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
HOXB7P09629 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
HOXB7P09629 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
HOXB7P09629 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
HOXB7P09629 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
HOXB7P09629 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
HOXB7P09629 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
HOXB7P09629 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
HOXB7P09629 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
HOXB7P09629 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
HOXB7P09629 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HOXB7P09629 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HOXB7P09629 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HOXB7P09629 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
HOXB7P09629 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
HOXB7P09629 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
HOXB7P09629 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HOXB7P09629 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HOXB7P09629 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HOXB7P09629 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HOXB7P09629 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms