Protein–RNA interactions for Protein: P09012

SNRPA, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPAP09012 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRPAP09012 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRPAP09012 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRPAP09012 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRPAP09012 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRPAP09012 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRPAP09012 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRPAP09012 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRPAP09012 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRPAP09012 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRPAP09012 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRPAP09012 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRPAP09012 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRPAP09012 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRPAP09012 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRPAP09012 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRPAP09012 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRPAP09012 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRPAP09012 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRPAP09012 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRPAP09012 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRPAP09012 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRPAP09012 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRPAP09012 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRPAP09012 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNRPAP09012 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNRPAP09012 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNRPAP09012 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNRPAP09012 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRPAP09012 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRPAP09012 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRPAP09012 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRPAP09012 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRPAP09012 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRPAP09012 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRPAP09012 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNRPAP09012 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SNRPAP09012 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRPAP09012 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRPAP09012 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRPAP09012 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRPAP09012 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRPAP09012 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRPAP09012 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRPAP09012 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRPAP09012 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNRPAP09012 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRPAP09012 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRPAP09012 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRPAP09012 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNRPAP09012 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPAP09012 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPAP09012 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPAP09012 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPAP09012 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPAP09012 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPAP09012 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNRPAP09012 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRPAP09012 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNRPAP09012 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRPAP09012 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRPAP09012 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRPAP09012 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRPAP09012 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRPAP09012 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRPAP09012 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRPAP09012 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRPAP09012 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNRPAP09012 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNRPAP09012 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNRPAP09012 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNRPAP09012 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRPAP09012 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRPAP09012 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRPAP09012 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRPAP09012 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRPAP09012 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRPAP09012 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRPAP09012 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRPAP09012 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRPAP09012 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRPAP09012 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRPAP09012 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRPAP09012 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRPAP09012 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRPAP09012 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRPAP09012 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRPAP09012 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRPAP09012 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRPAP09012 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRPAP09012 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRPAP09012 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRPAP09012 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRPAP09012 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRPAP09012 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNRPAP09012 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRPAP09012 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRPAP09012 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRPAP09012 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRPAP09012 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms