Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TPM2P07951 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TPM2P07951 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TPM2P07951 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TPM2P07951 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TPM2P07951 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TPM2P07951 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TPM2P07951 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TPM2P07951 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TPM2P07951 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TPM2P07951 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TPM2P07951 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TPM2P07951 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TPM2P07951 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TPM2P07951 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TPM2P07951 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TPM2P07951 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TPM2P07951 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TPM2P07951 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TPM2P07951 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TPM2P07951 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TPM2P07951 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TPM2P07951 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TPM2P07951 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TPM2P07951 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TPM2P07951 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TPM2P07951 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TPM2P07951 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TPM2P07951 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TPM2P07951 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TPM2P07951 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TPM2P07951 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TPM2P07951 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TPM2P07951 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TPM2P07951 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TPM2P07951 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TPM2P07951 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TPM2P07951 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TPM2P07951 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TPM2P07951 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TPM2P07951 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TPM2P07951 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TPM2P07951 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TPM2P07951 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TPM2P07951 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TPM2P07951 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TPM2P07951 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TPM2P07951 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TPM2P07951 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
TPM2P07951 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TPM2P07951 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TPM2P07951 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TPM2P07951 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
TPM2P07951 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
TPM2P07951 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TPM2P07951 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TPM2P07951 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TPM2P07951 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TPM2P07951 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TPM2P07951 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
TPM2P07951 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
TPM2P07951 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TPM2P07951 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TPM2P07951 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TPM2P07951 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TPM2P07951 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TPM2P07951 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TPM2P07951 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TPM2P07951 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TPM2P07951 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TPM2P07951 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TPM2P07951 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TPM2P07951 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TPM2P07951 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TPM2P07951 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TPM2P07951 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TPM2P07951 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TPM2P07951 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TPM2P07951 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TPM2P07951 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TPM2P07951 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TPM2P07951 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TPM2P07951 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TPM2P07951 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TPM2P07951 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TPM2P07951 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TPM2P07951 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TPM2P07951 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TPM2P07951 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TPM2P07951 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TPM2P07951 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TPM2P07951 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TPM2P07951 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TPM2P07951 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TPM2P07951 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TPM2P07951 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TPM2P07951 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TPM2P07951 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TPM2P07951 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TPM2P07951 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms