Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APODP05090 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APODP05090 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APODP05090 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APODP05090 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APODP05090 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APODP05090 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APODP05090 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APODP05090 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APODP05090 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APODP05090 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APODP05090 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APODP05090 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APODP05090 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APODP05090 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APODP05090 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APODP05090 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APODP05090 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APODP05090 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APODP05090 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APODP05090 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APODP05090 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APODP05090 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
APODP05090 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APODP05090 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APODP05090 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APODP05090 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APODP05090 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APODP05090 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APODP05090 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
APODP05090 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APODP05090 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APODP05090 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APODP05090 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
APODP05090 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APODP05090 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APODP05090 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APODP05090 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APODP05090 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APODP05090 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APODP05090 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APODP05090 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APODP05090 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
APODP05090 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APODP05090 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APODP05090 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APODP05090 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APODP05090 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APODP05090 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APODP05090 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APODP05090 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APODP05090 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APODP05090 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
APODP05090 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APODP05090 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APODP05090 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APODP05090 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APODP05090 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APODP05090 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APODP05090 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APODP05090 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APODP05090 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
APODP05090 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
APODP05090 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APODP05090 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
APODP05090 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APODP05090 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APODP05090 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APODP05090 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APODP05090 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APODP05090 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APODP05090 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APODP05090 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APODP05090 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APODP05090 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APODP05090 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APODP05090 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APODP05090 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
APODP05090 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APODP05090 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APODP05090 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APODP05090 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APODP05090 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APODP05090 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APODP05090 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APODP05090 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APODP05090 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APODP05090 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
APODP05090 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APODP05090 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APODP05090 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
APODP05090 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APODP05090 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APODP05090 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APODP05090 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APODP05090 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APODP05090 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APODP05090 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APODP05090 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APODP05090 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms