Protein–RNA interactions for Protein: P04756

Chrna1, Acetylcholine receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna1P04756 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chrna1P04756 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chrna1P04756 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chrna1P04756 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrna1P04756 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrna1P04756 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrna1P04756 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrna1P04756 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrna1P04756 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna1P04756 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna1P04756 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna1P04756 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chrna1P04756 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chrna1P04756 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chrna1P04756 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chrna1P04756 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chrna1P04756 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chrna1P04756 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chrna1P04756 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chrna1P04756 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chrna1P04756 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Chrna1P04756 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chrna1P04756 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chrna1P04756 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chrna1P04756 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chrna1P04756 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chrna1P04756 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chrna1P04756 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Chrna1P04756 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chrna1P04756 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chrna1P04756 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chrna1P04756 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chrna1P04756 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chrna1P04756 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chrna1P04756 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chrna1P04756 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chrna1P04756 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chrna1P04756 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chrna1P04756 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chrna1P04756 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chrna1P04756 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chrna1P04756 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Chrna1P04756 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Chrna1P04756 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Chrna1P04756 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Chrna1P04756 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chrna1P04756 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chrna1P04756 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chrna1P04756 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chrna1P04756 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna1P04756 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna1P04756 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna1P04756 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna1P04756 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrna1P04756 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrna1P04756 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrna1P04756 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrna1P04756 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrna1P04756 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chrna1P04756 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chrna1P04756 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chrna1P04756 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chrna1P04756 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chrna1P04756 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Chrna1P04756 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chrna1P04756 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chrna1P04756 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chrna1P04756 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chrna1P04756 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chrna1P04756 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chrna1P04756 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chrna1P04756 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chrna1P04756 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chrna1P04756 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chrna1P04756 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chrna1P04756 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chrna1P04756 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chrna1P04756 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chrna1P04756 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chrna1P04756 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chrna1P04756 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chrna1P04756 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chrna1P04756 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chrna1P04756 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chrna1P04756 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chrna1P04756 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Chrna1P04756 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chrna1P04756 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chrna1P04756 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chrna1P04756 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chrna1P04756 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrna1P04756 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrna1P04756 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrna1P04756 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chrna1P04756 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chrna1P04756 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chrna1P04756 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chrna1P04756 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chrna1P04756 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chrna1P04756 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms