Protein–RNA interactions for Protein: P04632

CAPNS1, Calpain small subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1P04632 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1P04632 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1P04632 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1P04632 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1P04632 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1P04632 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1P04632 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1P04632 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1P04632 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1P04632 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1P04632 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1P04632 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1P04632 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1P04632 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1P04632 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1P04632 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1P04632 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1P04632 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1P04632 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1P04632 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1P04632 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1P04632 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1P04632 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1P04632 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1P04632 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1P04632 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1P04632 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1P04632 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1P04632 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1P04632 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1P04632 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1P04632 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1P04632 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1P04632 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1P04632 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1P04632 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1P04632 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1P04632 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAPNS1P04632 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms