Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
H2-Eb1P04230 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2-Eb1P04230 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2-Eb1P04230 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-Eb1P04230 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-Eb1P04230 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-Eb1P04230 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-Eb1P04230 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-Eb1P04230 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-Eb1P04230 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-Eb1P04230 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-Eb1P04230 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-Eb1P04230 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-Eb1P04230 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-Eb1P04230 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Eb1P04230 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Eb1P04230 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Eb1P04230 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Eb1P04230 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Eb1P04230 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Eb1P04230 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-Eb1P04230 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-Eb1P04230 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-Eb1P04230 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-Eb1P04230 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-Eb1P04230 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-Eb1P04230 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-Eb1P04230 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-Eb1P04230 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-Eb1P04230 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms