Protein–RNA interactions for Protein: P02771

AFP, Alpha-fetoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFPP02771 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
AFPP02771 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
AFPP02771 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AFPP02771 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AFPP02771 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AFPP02771 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
AFPP02771 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AFPP02771 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AFPP02771 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
AFPP02771 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AFPP02771 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AFPP02771 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AFPP02771 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AFPP02771 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AFPP02771 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AFPP02771 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AFPP02771 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AFPP02771 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AFPP02771 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AFPP02771 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AFPP02771 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AFPP02771 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AFPP02771 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AFPP02771 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AFPP02771 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AFPP02771 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AFPP02771 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AFPP02771 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AFPP02771 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AFPP02771 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AFPP02771 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AFPP02771 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AFPP02771 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AFPP02771 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AFPP02771 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
AFPP02771 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AFPP02771 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
AFPP02771 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AFPP02771 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AFPP02771 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AFPP02771 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AFPP02771 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AFPP02771 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AFPP02771 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AFPP02771 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AFPP02771 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AFPP02771 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AFPP02771 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AFPP02771 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AFPP02771 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AFPP02771 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AFPP02771 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AFPP02771 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AFPP02771 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AFPP02771 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AFPP02771 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AFPP02771 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AFPP02771 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AFPP02771 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AFPP02771 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AFPP02771 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AFPP02771 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
AFPP02771 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
AFPP02771 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
AFPP02771 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
AFPP02771 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AFPP02771 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
AFPP02771 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
AFPP02771 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
AFPP02771 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AFPP02771 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AFPP02771 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AFPP02771 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AFPP02771 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AFPP02771 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AFPP02771 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
AFPP02771 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
AFPP02771 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AFPP02771 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AFPP02771 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AFPP02771 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AFPP02771 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AFPP02771 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
AFPP02771 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
AFPP02771 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
AFPP02771 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AFPP02771 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AFPP02771 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AFPP02771 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
AFPP02771 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AFPP02771 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AFPP02771 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AFPP02771 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
AFPP02771 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AFPP02771 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AFPP02771 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AFPP02771 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
AFPP02771 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AFPP02771 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AFPP02771 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms