Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOEP02649 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOEP02649 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOEP02649 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOEP02649 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOEP02649 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOEP02649 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOEP02649 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOEP02649 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOEP02649 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOEP02649 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOEP02649 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
APOEP02649 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOEP02649 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOEP02649 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOEP02649 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOEP02649 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOEP02649 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOEP02649 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOEP02649 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOEP02649 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOEP02649 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOEP02649 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOEP02649 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOEP02649 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOEP02649 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOEP02649 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOEP02649 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOEP02649 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOEP02649 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOEP02649 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOEP02649 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOEP02649 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOEP02649 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOEP02649 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOEP02649 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOEP02649 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOEP02649 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOEP02649 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOEP02649 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOEP02649 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOEP02649 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOEP02649 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOEP02649 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
APOEP02649 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
APOEP02649 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
APOEP02649 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOEP02649 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOEP02649 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOEP02649 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
APOEP02649 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOEP02649 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOEP02649 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOEP02649 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOEP02649 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
APOEP02649 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOEP02649 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOEP02649 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOEP02649 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOEP02649 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOEP02649 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOEP02649 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOEP02649 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOEP02649 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOEP02649 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
APOEP02649 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOEP02649 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
APOEP02649 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOEP02649 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOEP02649 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOEP02649 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOEP02649 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOEP02649 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOEP02649 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOEP02649 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOEP02649 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOEP02649 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOEP02649 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOEP02649 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOEP02649 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOEP02649 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
APOEP02649 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOEP02649 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOEP02649 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOEP02649 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOEP02649 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOEP02649 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOEP02649 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOEP02649 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOEP02649 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOEP02649 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOEP02649 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOEP02649 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOEP02649 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
APOEP02649 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOEP02649 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
APOEP02649 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOEP02649 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOEP02649 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOEP02649 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms