Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMNAP02545 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMNAP02545 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMNAP02545 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LMNAP02545 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMNAP02545 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMNAP02545 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMNAP02545 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMNAP02545 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMNAP02545 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMNAP02545 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMNAP02545 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMNAP02545 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LMNAP02545 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMNAP02545 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LMNAP02545 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMNAP02545 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMNAP02545 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMNAP02545 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMNAP02545 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMNAP02545 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LMNAP02545 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMNAP02545 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMNAP02545 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMNAP02545 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMNAP02545 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMNAP02545 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LMNAP02545 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMNAP02545 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMNAP02545 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMNAP02545 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMNAP02545 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LMNAP02545 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMNAP02545 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMNAP02545 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMNAP02545 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMNAP02545 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMNAP02545 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMNAP02545 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMNAP02545 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMNAP02545 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMNAP02545 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMNAP02545 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMNAP02545 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMNAP02545 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMNAP02545 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMNAP02545 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMNAP02545 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMNAP02545 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMNAP02545 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMNAP02545 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMNAP02545 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMNAP02545 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMNAP02545 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMNAP02545 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMNAP02545 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMNAP02545 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMNAP02545 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMNAP02545 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMNAP02545 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMNAP02545 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMNAP02545 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMNAP02545 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMNAP02545 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMNAP02545 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMNAP02545 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMNAP02545 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMNAP02545 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMNAP02545 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMNAP02545 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMNAP02545 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMNAP02545 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LMNAP02545 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LMNAP02545 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMNAP02545 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMNAP02545 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMNAP02545 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMNAP02545 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMNAP02545 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMNAP02545 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMNAP02545 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMNAP02545 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMNAP02545 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LMNAP02545 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMNAP02545 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMNAP02545 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMNAP02545 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMNAP02545 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMNAP02545 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMNAP02545 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMNAP02545 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMNAP02545 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LMNAP02545 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMNAP02545 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMNAP02545 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMNAP02545 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMNAP02545 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LMNAP02545 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LMNAP02545 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LMNAP02545 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms