Protein–RNA interactions for Protein: P02340

Tp53, Cellular tumor antigen p53, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53P02340 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tp53P02340 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tp53P02340 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tp53P02340 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tp53P02340 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tp53P02340 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tp53P02340 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tp53P02340 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tp53P02340 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tp53P02340 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tp53P02340 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tp53P02340 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tp53P02340 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tp53P02340 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tp53P02340 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tp53P02340 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tp53P02340 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tp53P02340 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tp53P02340 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tp53P02340 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tp53P02340 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tp53P02340 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tp53P02340 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tp53P02340 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tp53P02340 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tp53P02340 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tp53P02340 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tp53P02340 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tp53P02340 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tp53P02340 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tp53P02340 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tp53P02340 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tp53P02340 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tp53P02340 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tp53P02340 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tp53P02340 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tp53P02340 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tp53P02340 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tp53P02340 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tp53P02340 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tp53P02340 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tp53P02340 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tp53P02340 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tp53P02340 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tp53P02340 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tp53P02340 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tp53P02340 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tp53P02340 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tp53P02340 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tp53P02340 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tp53P02340 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tp53P02340 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tp53P02340 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tp53P02340 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tp53P02340 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tp53P02340 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tp53P02340 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tp53P02340 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tp53P02340 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tp53P02340 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tp53P02340 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tp53P02340 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tp53P02340 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tp53P02340 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tp53P02340 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tp53P02340 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tp53P02340 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tp53P02340 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tp53P02340 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tp53P02340 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tp53P02340 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tp53P02340 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tp53P02340 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tp53P02340 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tp53P02340 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tp53P02340 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tp53P02340 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tp53P02340 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tp53P02340 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tp53P02340 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tp53P02340 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tp53P02340 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tp53P02340 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tp53P02340 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tp53P02340 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tp53P02340 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tp53P02340 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tp53P02340 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tp53P02340 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tp53P02340 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tp53P02340 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tp53P02340 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tp53P02340 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tp53P02340 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tp53P02340 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tp53P02340 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tp53P02340 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tp53P02340 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tp53P02340 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tp53P02340 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms