Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01747 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01747 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01747 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01747 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01747 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01747 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01747 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01747 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01747 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01747 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01747 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01747 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01747 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01747 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01747 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01747 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01747 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P01747 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01747 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01747 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01747 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01747 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01747 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01747 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01747 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01747 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01747 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01747 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01747 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01747 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
P01747 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01747 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01747 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01747 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
P01747 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01747 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01747 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01747 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01747 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01747 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01747 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01747 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
P01747 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01747 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01747 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01747 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01747 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01747 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01747 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01747 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01747 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01747 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01747 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01747 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01747 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01747 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01747 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01747 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01747 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01747 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01747 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01747 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01747 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01747 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01747 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01747 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01747 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01747 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
P01747 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01747 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01747 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01747 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01747 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01747 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01747 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01747 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01747 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P01747 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01747 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01747 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01747 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01747 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01747 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01747 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01747 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01747 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01747 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01747 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01747 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01747 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01747 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01747 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01747 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01747 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01747 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01747 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01747 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01747 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01747 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms