Protein–RNA interactions for Protein: O96015

DNAL4, Dynein light chain 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAL4O96015 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAL4O96015 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAL4O96015 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAL4O96015 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAL4O96015 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAL4O96015 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAL4O96015 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAL4O96015 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms