Protein–RNA interactions for Protein: O95977

S1PR4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR4O95977 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
S1PR4O95977 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
S1PR4O95977 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
S1PR4O95977 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
S1PR4O95977 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
S1PR4O95977 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
S1PR4O95977 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
S1PR4O95977 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
S1PR4O95977 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
S1PR4O95977 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
S1PR4O95977 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
S1PR4O95977 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
S1PR4O95977 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
S1PR4O95977 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
S1PR4O95977 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
S1PR4O95977 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
S1PR4O95977 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
S1PR4O95977 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
S1PR4O95977 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
S1PR4O95977 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
S1PR4O95977 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
S1PR4O95977 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
S1PR4O95977 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
S1PR4O95977 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
S1PR4O95977 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
S1PR4O95977 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
S1PR4O95977 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
S1PR4O95977 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
S1PR4O95977 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
S1PR4O95977 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
S1PR4O95977 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
S1PR4O95977 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
S1PR4O95977 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
S1PR4O95977 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
S1PR4O95977 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
S1PR4O95977 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
S1PR4O95977 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
S1PR4O95977 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
S1PR4O95977 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
S1PR4O95977 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
S1PR4O95977 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
S1PR4O95977 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
S1PR4O95977 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
S1PR4O95977 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
S1PR4O95977 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
S1PR4O95977 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
S1PR4O95977 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
S1PR4O95977 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
S1PR4O95977 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
S1PR4O95977 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
S1PR4O95977 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
S1PR4O95977 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
S1PR4O95977 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
S1PR4O95977 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
S1PR4O95977 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
S1PR4O95977 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
S1PR4O95977 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
S1PR4O95977 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
S1PR4O95977 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
S1PR4O95977 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms