Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BRD1O95696 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
BRD1O95696 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BRD1O95696 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRD1O95696 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
BRD1O95696 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRD1O95696 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRD1O95696 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRD1O95696 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRD1O95696 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRD1O95696 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRD1O95696 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRD1O95696 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRD1O95696 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRD1O95696 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRD1O95696 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRD1O95696 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRD1O95696 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRD1O95696 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRD1O95696 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRD1O95696 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRD1O95696 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRD1O95696 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRD1O95696 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRD1O95696 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRD1O95696 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRD1O95696 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRD1O95696 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
BRD1O95696 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRD1O95696 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
BRD1O95696 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRD1O95696 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRD1O95696 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRD1O95696 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRD1O95696 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRD1O95696 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRD1O95696 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRD1O95696 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRD1O95696 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRD1O95696 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRD1O95696 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
BRD1O95696 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRD1O95696 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRD1O95696 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRD1O95696 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRD1O95696 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRD1O95696 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRD1O95696 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRD1O95696 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRD1O95696 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRD1O95696 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRD1O95696 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRD1O95696 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRD1O95696 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRD1O95696 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRD1O95696 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRD1O95696 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRD1O95696 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRD1O95696 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRD1O95696 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRD1O95696 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRD1O95696 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRD1O95696 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRD1O95696 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
BRD1O95696 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRD1O95696 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRD1O95696 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRD1O95696 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRD1O95696 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRD1O95696 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRD1O95696 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRD1O95696 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRD1O95696 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRD1O95696 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRD1O95696 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRD1O95696 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRD1O95696 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRD1O95696 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRD1O95696 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRD1O95696 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRD1O95696 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
BRD1O95696 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRD1O95696 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRD1O95696 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRD1O95696 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRD1O95696 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRD1O95696 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BRD1O95696 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BRD1O95696 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRD1O95696 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRD1O95696 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRD1O95696 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRD1O95696 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRD1O95696 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRD1O95696 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRD1O95696 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRD1O95696 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRD1O95696 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRD1O95696 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BRD1O95696 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms