Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
POLR1AO95602 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
POLR1AO95602 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
POLR1AO95602 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
POLR1AO95602 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
POLR1AO95602 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
POLR1AO95602 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
POLR1AO95602 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
POLR1AO95602 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
POLR1AO95602 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
POLR1AO95602 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
POLR1AO95602 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
POLR1AO95602 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
POLR1AO95602 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
POLR1AO95602 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
POLR1AO95602 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
POLR1AO95602 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
POLR1AO95602 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
POLR1AO95602 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
POLR1AO95602 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
POLR1AO95602 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
POLR1AO95602 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
POLR1AO95602 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
POLR1AO95602 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
POLR1AO95602 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
POLR1AO95602 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
POLR1AO95602 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
POLR1AO95602 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
POLR1AO95602 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
POLR1AO95602 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
POLR1AO95602 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
POLR1AO95602 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
POLR1AO95602 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
POLR1AO95602 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
POLR1AO95602 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
POLR1AO95602 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
POLR1AO95602 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
POLR1AO95602 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
POLR1AO95602 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
POLR1AO95602 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
POLR1AO95602 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.38
POLR1AO95602 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
POLR1AO95602 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
POLR1AO95602 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
POLR1AO95602 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
POLR1AO95602 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
POLR1AO95602 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
POLR1AO95602 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
POLR1AO95602 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
POLR1AO95602 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
POLR1AO95602 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
POLR1AO95602 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
POLR1AO95602 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
POLR1AO95602 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
POLR1AO95602 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
POLR1AO95602 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
POLR1AO95602 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
POLR1AO95602 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
POLR1AO95602 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
POLR1AO95602 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
POLR1AO95602 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
POLR1AO95602 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
POLR1AO95602 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
POLR1AO95602 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
POLR1AO95602 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
POLR1AO95602 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
POLR1AO95602 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
POLR1AO95602 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
POLR1AO95602 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
POLR1AO95602 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
POLR1AO95602 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
POLR1AO95602 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
POLR1AO95602 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
POLR1AO95602 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
POLR1AO95602 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
POLR1AO95602 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
POLR1AO95602 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
POLR1AO95602 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
POLR1AO95602 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
POLR1AO95602 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
POLR1AO95602 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
POLR1AO95602 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
POLR1AO95602 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
POLR1AO95602 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
POLR1AO95602 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
POLR1AO95602 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
POLR1AO95602 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC36.05■■■■□ 3.36
POLR1AO95602 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
POLR1AO95602 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
POLR1AO95602 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
POLR1AO95602 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
POLR1AO95602 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
POLR1AO95602 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
POLR1AO95602 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
POLR1AO95602 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
POLR1AO95602 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
POLR1AO95602 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
POLR1AO95602 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
POLR1AO95602 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC36.02■■■■□ 3.36
POLR1AO95602 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms