Protein–RNA interactions for Protein: O94993

SOX30, Transcription factor SOX-30, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX30O94993 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX30O94993 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX30O94993 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX30O94993 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX30O94993 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX30O94993 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX30O94993 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX30O94993 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX30O94993 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX30O94993 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX30O94993 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX30O94993 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX30O94993 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX30O94993 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX30O94993 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX30O94993 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX30O94993 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX30O94993 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX30O94993 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX30O94993 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX30O94993 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX30O94993 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX30O94993 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX30O94993 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX30O94993 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX30O94993 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX30O94993 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX30O94993 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX30O94993 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX30O94993 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX30O94993 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX30O94993 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX30O94993 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX30O94993 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX30O94993 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX30O94993 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX30O94993 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX30O94993 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX30O94993 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX30O94993 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX30O94993 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX30O94993 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX30O94993 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX30O94993 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX30O94993 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX30O94993 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX30O94993 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX30O94993 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX30O94993 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX30O94993 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX30O94993 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX30O94993 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX30O94993 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX30O94993 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX30O94993 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX30O94993 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX30O94993 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX30O94993 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX30O94993 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX30O94993 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX30O94993 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX30O94993 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX30O94993 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX30O94993 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX30O94993 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX30O94993 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX30O94993 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX30O94993 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX30O94993 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX30O94993 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX30O94993 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX30O94993 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX30O94993 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX30O94993 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX30O94993 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX30O94993 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX30O94993 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX30O94993 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX30O94993 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX30O94993 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX30O94993 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX30O94993 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX30O94993 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX30O94993 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX30O94993 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX30O94993 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX30O94993 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX30O94993 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX30O94993 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX30O94993 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX30O94993 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX30O94993 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX30O94993 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX30O94993 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX30O94993 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOX30O94993 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOX30O94993 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOX30O94993 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX30O94993 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX30O94993 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms