Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRPF6O94906 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRPF6O94906 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF6O94906 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF6O94906 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF6O94906 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF6O94906 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF6O94906 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF6O94906 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF6O94906 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF6O94906 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPF6O94906 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPF6O94906 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPF6O94906 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPF6O94906 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPF6O94906 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPF6O94906 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPF6O94906 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF6O94906 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF6O94906 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF6O94906 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF6O94906 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF6O94906 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF6O94906 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF6O94906 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF6O94906 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF6O94906 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF6O94906 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF6O94906 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF6O94906 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF6O94906 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRPF6O94906 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRPF6O94906 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRPF6O94906 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPF6O94906 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPF6O94906 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPF6O94906 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPF6O94906 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPF6O94906 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPF6O94906 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF6O94906 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF6O94906 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF6O94906 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF6O94906 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF6O94906 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF6O94906 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF6O94906 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF6O94906 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF6O94906 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF6O94906 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF6O94906 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRPF6O94906 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRPF6O94906 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRPF6O94906 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF6O94906 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF6O94906 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF6O94906 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF6O94906 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF6O94906 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF6O94906 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF6O94906 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms