Protein–RNA interactions for Protein: O88990

Actn3, Alpha-actinin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn3O88990 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Actn3O88990 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Actn3O88990 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Actn3O88990 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Actn3O88990 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Actn3O88990 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Actn3O88990 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Actn3O88990 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Actn3O88990 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Actn3O88990 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Actn3O88990 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Actn3O88990 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Actn3O88990 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Actn3O88990 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Actn3O88990 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Actn3O88990 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Actn3O88990 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Actn3O88990 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Actn3O88990 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Actn3O88990 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Actn3O88990 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Actn3O88990 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Actn3O88990 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Actn3O88990 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Actn3O88990 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Actn3O88990 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Actn3O88990 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Actn3O88990 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Actn3O88990 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Actn3O88990 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Actn3O88990 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Actn3O88990 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Actn3O88990 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Actn3O88990 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Actn3O88990 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Actn3O88990 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Actn3O88990 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Actn3O88990 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Actn3O88990 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Actn3O88990 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Actn3O88990 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Actn3O88990 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Actn3O88990 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Actn3O88990 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Actn3O88990 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Actn3O88990 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Actn3O88990 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Actn3O88990 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Actn3O88990 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Actn3O88990 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Actn3O88990 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Actn3O88990 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Actn3O88990 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Actn3O88990 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Actn3O88990 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Actn3O88990 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Actn3O88990 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Actn3O88990 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Actn3O88990 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Actn3O88990 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Actn3O88990 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Actn3O88990 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Actn3O88990 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Actn3O88990 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Actn3O88990 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Actn3O88990 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Actn3O88990 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Actn3O88990 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Actn3O88990 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Actn3O88990 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Actn3O88990 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Actn3O88990 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Actn3O88990 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Actn3O88990 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Actn3O88990 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Actn3O88990 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Actn3O88990 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Actn3O88990 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Actn3O88990 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Actn3O88990 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Actn3O88990 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Actn3O88990 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Actn3O88990 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Actn3O88990 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Actn3O88990 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Actn3O88990 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Actn3O88990 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Actn3O88990 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Actn3O88990 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Actn3O88990 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Actn3O88990 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Actn3O88990 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Actn3O88990 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Actn3O88990 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Actn3O88990 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Actn3O88990 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Actn3O88990 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Actn3O88990 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Actn3O88990 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Actn3O88990 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.1 ms