Protein–RNA interactions for Protein: O88447

Klc1, Kinesin light chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc1O88447 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klc1O88447 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klc1O88447 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klc1O88447 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klc1O88447 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klc1O88447 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klc1O88447 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klc1O88447 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klc1O88447 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klc1O88447 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klc1O88447 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Klc1O88447 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klc1O88447 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Klc1O88447 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klc1O88447 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Klc1O88447 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klc1O88447 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klc1O88447 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klc1O88447 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klc1O88447 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klc1O88447 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klc1O88447 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klc1O88447 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klc1O88447 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klc1O88447 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klc1O88447 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klc1O88447 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Klc1O88447 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klc1O88447 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klc1O88447 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klc1O88447 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klc1O88447 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klc1O88447 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klc1O88447 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klc1O88447 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Klc1O88447 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Klc1O88447 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klc1O88447 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klc1O88447 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klc1O88447 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klc1O88447 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klc1O88447 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klc1O88447 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klc1O88447 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klc1O88447 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klc1O88447 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klc1O88447 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Klc1O88447 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klc1O88447 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klc1O88447 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klc1O88447 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klc1O88447 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klc1O88447 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klc1O88447 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klc1O88447 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klc1O88447 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klc1O88447 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klc1O88447 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klc1O88447 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klc1O88447 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klc1O88447 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klc1O88447 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Klc1O88447 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Klc1O88447 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Klc1O88447 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klc1O88447 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klc1O88447 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klc1O88447 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klc1O88447 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klc1O88447 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klc1O88447 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klc1O88447 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klc1O88447 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klc1O88447 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klc1O88447 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klc1O88447 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Klc1O88447 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klc1O88447 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klc1O88447 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Klc1O88447 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Klc1O88447 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klc1O88447 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klc1O88447 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klc1O88447 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klc1O88447 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klc1O88447 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klc1O88447 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klc1O88447 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Klc1O88447 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klc1O88447 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klc1O88447 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klc1O88447 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klc1O88447 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klc1O88447 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klc1O88447 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klc1O88447 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klc1O88447 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klc1O88447 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klc1O88447 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klc1O88447 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 478.6 ms