Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tnnt1O88346 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tnnt1O88346 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tnnt1O88346 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tnnt1O88346 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tnnt1O88346 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tnnt1O88346 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tnnt1O88346 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tnnt1O88346 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tnnt1O88346 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tnnt1O88346 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Tnnt1O88346 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tnnt1O88346 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tnnt1O88346 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tnnt1O88346 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tnnt1O88346 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tnnt1O88346 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tnnt1O88346 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tnnt1O88346 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tnnt1O88346 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tnnt1O88346 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tnnt1O88346 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tnnt1O88346 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tnnt1O88346 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tnnt1O88346 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tnnt1O88346 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tnnt1O88346 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tnnt1O88346 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tnnt1O88346 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Tnnt1O88346 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tnnt1O88346 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tnnt1O88346 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tnnt1O88346 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tnnt1O88346 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tnnt1O88346 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tnnt1O88346 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tnnt1O88346 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tnnt1O88346 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Tnnt1O88346 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tnnt1O88346 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tnnt1O88346 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tnnt1O88346 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tnnt1O88346 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tnnt1O88346 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tnnt1O88346 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tnnt1O88346 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tnnt1O88346 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tnnt1O88346 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tnnt1O88346 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tnnt1O88346 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tnnt1O88346 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tnnt1O88346 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tnnt1O88346 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tnnt1O88346 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tnnt1O88346 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tnnt1O88346 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tnnt1O88346 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tnnt1O88346 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tnnt1O88346 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tnnt1O88346 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tnnt1O88346 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tnnt1O88346 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tnnt1O88346 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tnnt1O88346 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tnnt1O88346 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tnnt1O88346 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tnnt1O88346 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tnnt1O88346 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tnnt1O88346 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tnnt1O88346 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tnnt1O88346 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tnnt1O88346 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tnnt1O88346 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tnnt1O88346 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tnnt1O88346 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tnnt1O88346 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tnnt1O88346 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tnnt1O88346 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tnnt1O88346 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tnnt1O88346 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tnnt1O88346 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Tnnt1O88346 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tnnt1O88346 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tnnt1O88346 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tnnt1O88346 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tnnt1O88346 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tnnt1O88346 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Tnnt1O88346 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tnnt1O88346 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tnnt1O88346 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tnnt1O88346 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tnnt1O88346 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tnnt1O88346 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Tnnt1O88346 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tnnt1O88346 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tnnt1O88346 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Tnnt1O88346 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tnnt1O88346 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tnnt1O88346 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tnnt1O88346 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms