Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Cfdp1O88271 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cfdp1O88271 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cfdp1O88271 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cfdp1O88271 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cfdp1O88271 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cfdp1O88271 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cfdp1O88271 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cfdp1O88271 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cfdp1O88271 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cfdp1O88271 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cfdp1O88271 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cfdp1O88271 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cfdp1O88271 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cfdp1O88271 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cfdp1O88271 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cfdp1O88271 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Cfdp1O88271 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cfdp1O88271 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cfdp1O88271 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cfdp1O88271 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cfdp1O88271 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cfdp1O88271 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cfdp1O88271 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cfdp1O88271 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cfdp1O88271 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cfdp1O88271 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cfdp1O88271 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cfdp1O88271 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cfdp1O88271 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cfdp1O88271 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cfdp1O88271 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cfdp1O88271 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cfdp1O88271 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cfdp1O88271 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cfdp1O88271 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cfdp1O88271 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cfdp1O88271 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cfdp1O88271 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cfdp1O88271 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Cfdp1O88271 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cfdp1O88271 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cfdp1O88271 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cfdp1O88271 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cfdp1O88271 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cfdp1O88271 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cfdp1O88271 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cfdp1O88271 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cfdp1O88271 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Cfdp1O88271 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cfdp1O88271 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cfdp1O88271 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cfdp1O88271 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cfdp1O88271 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cfdp1O88271 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cfdp1O88271 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cfdp1O88271 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cfdp1O88271 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cfdp1O88271 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cfdp1O88271 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cfdp1O88271 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cfdp1O88271 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cfdp1O88271 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cfdp1O88271 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cfdp1O88271 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cfdp1O88271 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cfdp1O88271 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cfdp1O88271 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cfdp1O88271 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cfdp1O88271 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cfdp1O88271 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Cfdp1O88271 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cfdp1O88271 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cfdp1O88271 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cfdp1O88271 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cfdp1O88271 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cfdp1O88271 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cfdp1O88271 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cfdp1O88271 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cfdp1O88271 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cfdp1O88271 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cfdp1O88271 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cfdp1O88271 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cfdp1O88271 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cfdp1O88271 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cfdp1O88271 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cfdp1O88271 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cfdp1O88271 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cfdp1O88271 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cfdp1O88271 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cfdp1O88271 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cfdp1O88271 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cfdp1O88271 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cfdp1O88271 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cfdp1O88271 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cfdp1O88271 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cfdp1O88271 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cfdp1O88271 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cfdp1O88271 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cfdp1O88271 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms