Protein–RNA interactions for Protein: O75604

USP2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP2O75604 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP2O75604 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP2O75604 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP2O75604 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP2O75604 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP2O75604 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP2O75604 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP2O75604 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP2O75604 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP2O75604 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP2O75604 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP2O75604 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP2O75604 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP2O75604 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP2O75604 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP2O75604 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP2O75604 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP2O75604 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP2O75604 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP2O75604 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP2O75604 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP2O75604 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
USP2O75604 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP2O75604 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP2O75604 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP2O75604 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP2O75604 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP2O75604 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP2O75604 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP2O75604 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP2O75604 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP2O75604 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP2O75604 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP2O75604 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP2O75604 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP2O75604 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP2O75604 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP2O75604 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP2O75604 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP2O75604 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP2O75604 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP2O75604 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP2O75604 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP2O75604 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP2O75604 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP2O75604 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP2O75604 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP2O75604 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP2O75604 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
USP2O75604 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP2O75604 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP2O75604 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP2O75604 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP2O75604 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP2O75604 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP2O75604 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP2O75604 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
USP2O75604 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP2O75604 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP2O75604 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP2O75604 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP2O75604 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP2O75604 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP2O75604 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP2O75604 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP2O75604 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP2O75604 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP2O75604 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP2O75604 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP2O75604 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP2O75604 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP2O75604 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP2O75604 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP2O75604 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP2O75604 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP2O75604 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
USP2O75604 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP2O75604 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP2O75604 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP2O75604 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
USP2O75604 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP2O75604 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP2O75604 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP2O75604 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
USP2O75604 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP2O75604 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
USP2O75604 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP2O75604 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP2O75604 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP2O75604 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP2O75604 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP2O75604 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
USP2O75604 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP2O75604 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP2O75604 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP2O75604 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP2O75604 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP2O75604 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP2O75604 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP2O75604 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 747.6 ms