Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPF40AO75400 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPF40AO75400 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPF40AO75400 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPF40AO75400 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPF40AO75400 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPF40AO75400 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPF40AO75400 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPF40AO75400 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPF40AO75400 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPF40AO75400 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPF40AO75400 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRPF40AO75400 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRPF40AO75400 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRPF40AO75400 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRPF40AO75400 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF40AO75400 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF40AO75400 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF40AO75400 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF40AO75400 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF40AO75400 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF40AO75400 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF40AO75400 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRPF40AO75400 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRPF40AO75400 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRPF40AO75400 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRPF40AO75400 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRPF40AO75400 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRPF40AO75400 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PRPF40AO75400 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPF40AO75400 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPF40AO75400 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPF40AO75400 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRPF40AO75400 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRPF40AO75400 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRPF40AO75400 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRPF40AO75400 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRPF40AO75400 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRPF40AO75400 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRPF40AO75400 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF40AO75400 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF40AO75400 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF40AO75400 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRPF40AO75400 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRPF40AO75400 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRPF40AO75400 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRPF40AO75400 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PRPF40AO75400 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRPF40AO75400 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRPF40AO75400 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRPF40AO75400 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRPF40AO75400 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRPF40AO75400 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRPF40AO75400 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRPF40AO75400 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PRPF40AO75400 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRPF40AO75400 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRPF40AO75400 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRPF40AO75400 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRPF40AO75400 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRPF40AO75400 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRPF40AO75400 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms