Protein–RNA interactions for Protein: O75264

SMIM24, Small integral membrane protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM24O75264 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM24O75264 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM24O75264 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM24O75264 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM24O75264 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM24O75264 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM24O75264 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM24O75264 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM24O75264 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM24O75264 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM24O75264 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM24O75264 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM24O75264 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM24O75264 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM24O75264 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM24O75264 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM24O75264 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM24O75264 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM24O75264 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM24O75264 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM24O75264 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM24O75264 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM24O75264 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM24O75264 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM24O75264 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM24O75264 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM24O75264 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM24O75264 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM24O75264 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM24O75264 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM24O75264 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM24O75264 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM24O75264 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM24O75264 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM24O75264 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM24O75264 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMIM24O75264 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM24O75264 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM24O75264 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM24O75264 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM24O75264 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM24O75264 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM24O75264 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM24O75264 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM24O75264 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM24O75264 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM24O75264 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM24O75264 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM24O75264 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM24O75264 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM24O75264 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM24O75264 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM24O75264 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM24O75264 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM24O75264 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM24O75264 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM24O75264 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM24O75264 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM24O75264 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM24O75264 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM24O75264 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM24O75264 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM24O75264 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM24O75264 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMIM24O75264 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMIM24O75264 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMIM24O75264 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMIM24O75264 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMIM24O75264 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMIM24O75264 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM24O75264 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM24O75264 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM24O75264 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM24O75264 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM24O75264 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM24O75264 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM24O75264 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM24O75264 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM24O75264 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM24O75264 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM24O75264 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM24O75264 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM24O75264 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM24O75264 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM24O75264 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM24O75264 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM24O75264 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM24O75264 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM24O75264 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM24O75264 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM24O75264 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM24O75264 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM24O75264 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM24O75264 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM24O75264 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM24O75264 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM24O75264 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM24O75264 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM24O75264 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM24O75264 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms