Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
N4BP1O75113 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
N4BP1O75113 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
N4BP1O75113 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
N4BP1O75113 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
N4BP1O75113 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
N4BP1O75113 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
N4BP1O75113 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
N4BP1O75113 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
N4BP1O75113 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
N4BP1O75113 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
N4BP1O75113 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
N4BP1O75113 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
N4BP1O75113 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
N4BP1O75113 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
N4BP1O75113 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
N4BP1O75113 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
N4BP1O75113 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
N4BP1O75113 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
N4BP1O75113 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
N4BP1O75113 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
N4BP1O75113 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
N4BP1O75113 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
N4BP1O75113 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
N4BP1O75113 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
N4BP1O75113 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
N4BP1O75113 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
N4BP1O75113 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
N4BP1O75113 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
N4BP1O75113 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
N4BP1O75113 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
N4BP1O75113 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
N4BP1O75113 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
N4BP1O75113 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
N4BP1O75113 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
N4BP1O75113 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
N4BP1O75113 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
N4BP1O75113 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
N4BP1O75113 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
N4BP1O75113 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
N4BP1O75113 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
N4BP1O75113 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
N4BP1O75113 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
N4BP1O75113 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
N4BP1O75113 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
N4BP1O75113 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
N4BP1O75113 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
N4BP1O75113 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
N4BP1O75113 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
N4BP1O75113 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
N4BP1O75113 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
N4BP1O75113 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
N4BP1O75113 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
N4BP1O75113 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
N4BP1O75113 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
N4BP1O75113 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
N4BP1O75113 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
N4BP1O75113 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
N4BP1O75113 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
N4BP1O75113 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
N4BP1O75113 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
N4BP1O75113 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
N4BP1O75113 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
N4BP1O75113 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
N4BP1O75113 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
N4BP1O75113 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
N4BP1O75113 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
N4BP1O75113 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
N4BP1O75113 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
N4BP1O75113 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
N4BP1O75113 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
N4BP1O75113 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
N4BP1O75113 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
N4BP1O75113 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
N4BP1O75113 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
N4BP1O75113 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
N4BP1O75113 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
N4BP1O75113 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
N4BP1O75113 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
N4BP1O75113 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
N4BP1O75113 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
N4BP1O75113 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
N4BP1O75113 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
N4BP1O75113 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
N4BP1O75113 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
N4BP1O75113 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
N4BP1O75113 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
N4BP1O75113 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
N4BP1O75113 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
N4BP1O75113 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
N4BP1O75113 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
N4BP1O75113 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
N4BP1O75113 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
N4BP1O75113 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
N4BP1O75113 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
N4BP1O75113 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
N4BP1O75113 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
N4BP1O75113 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
N4BP1O75113 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
N4BP1O75113 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms