Protein–RNA interactions for Protein: O70361

Per3, Period circadian protein homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Per3O70361 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Per3O70361 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Per3O70361 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Per3O70361 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Per3O70361 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Per3O70361 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Per3O70361 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Per3O70361 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Per3O70361 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Per3O70361 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Per3O70361 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Per3O70361 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Per3O70361 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Per3O70361 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Per3O70361 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Per3O70361 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Per3O70361 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Per3O70361 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Per3O70361 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Per3O70361 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Per3O70361 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Per3O70361 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Per3O70361 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Per3O70361 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Per3O70361 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Per3O70361 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Per3O70361 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Per3O70361 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Per3O70361 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Per3O70361 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Per3O70361 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Per3O70361 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Per3O70361 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Per3O70361 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Per3O70361 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Per3O70361 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Per3O70361 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Per3O70361 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Per3O70361 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Per3O70361 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Per3O70361 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Per3O70361 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Per3O70361 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Per3O70361 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Per3O70361 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Per3O70361 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Per3O70361 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Per3O70361 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Per3O70361 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Per3O70361 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Per3O70361 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Per3O70361 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Per3O70361 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Per3O70361 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Per3O70361 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Per3O70361 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Per3O70361 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Per3O70361 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Per3O70361 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Per3O70361 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Per3O70361 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Per3O70361 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Per3O70361 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Per3O70361 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Per3O70361 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Per3O70361 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Per3O70361 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Per3O70361 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Per3O70361 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Per3O70361 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Per3O70361 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Per3O70361 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Per3O70361 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Per3O70361 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Per3O70361 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Per3O70361 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Per3O70361 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Per3O70361 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Per3O70361 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Per3O70361 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Per3O70361 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Per3O70361 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Per3O70361 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Per3O70361 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Per3O70361 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Per3O70361 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Per3O70361 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Per3O70361 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Per3O70361 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Per3O70361 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Per3O70361 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Per3O70361 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Per3O70361 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Per3O70361 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Per3O70361 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Per3O70361 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Per3O70361 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Per3O70361 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Per3O70361 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Per3O70361 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms