Protein–RNA interactions for Protein: O60749

SNX2, Sorting nexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX2O60749 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX2O60749 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX2O60749 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX2O60749 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX2O60749 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX2O60749 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX2O60749 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX2O60749 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX2O60749 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX2O60749 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX2O60749 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX2O60749 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX2O60749 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX2O60749 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX2O60749 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX2O60749 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX2O60749 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX2O60749 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX2O60749 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX2O60749 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX2O60749 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX2O60749 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX2O60749 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX2O60749 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX2O60749 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX2O60749 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX2O60749 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX2O60749 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX2O60749 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX2O60749 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX2O60749 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX2O60749 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX2O60749 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX2O60749 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX2O60749 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX2O60749 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX2O60749 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX2O60749 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX2O60749 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX2O60749 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX2O60749 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX2O60749 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX2O60749 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX2O60749 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX2O60749 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX2O60749 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX2O60749 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX2O60749 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX2O60749 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX2O60749 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX2O60749 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX2O60749 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX2O60749 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX2O60749 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX2O60749 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX2O60749 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX2O60749 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX2O60749 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX2O60749 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX2O60749 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX2O60749 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX2O60749 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX2O60749 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX2O60749 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX2O60749 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX2O60749 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX2O60749 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX2O60749 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX2O60749 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX2O60749 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX2O60749 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX2O60749 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX2O60749 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX2O60749 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX2O60749 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX2O60749 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX2O60749 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX2O60749 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX2O60749 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX2O60749 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX2O60749 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX2O60749 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX2O60749 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX2O60749 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX2O60749 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SNX2O60749 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX2O60749 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX2O60749 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX2O60749 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX2O60749 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX2O60749 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX2O60749 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX2O60749 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX2O60749 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX2O60749 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX2O60749 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX2O60749 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX2O60749 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX2O60749 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX2O60749 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms