Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD2O60548 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXD2O60548 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FOXD2O60548 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FOXD2O60548 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXD2O60548 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXD2O60548 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXD2O60548 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXD2O60548 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXD2O60548 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXD2O60548 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD2O60548 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD2O60548 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD2O60548 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD2O60548 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD2O60548 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD2O60548 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD2O60548 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD2O60548 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD2O60548 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD2O60548 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD2O60548 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD2O60548 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD2O60548 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD2O60548 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD2O60548 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD2O60548 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD2O60548 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD2O60548 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD2O60548 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD2O60548 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD2O60548 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms