Protein–RNA interactions for Protein: O60235

TMPRSS11D, Transmembrane protease serine 11D, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11DO60235 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPRSS11DO60235 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMPRSS11DO60235 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPRSS11DO60235 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPRSS11DO60235 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPRSS11DO60235 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPRSS11DO60235 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPRSS11DO60235 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPRSS11DO60235 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPRSS11DO60235 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPRSS11DO60235 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPRSS11DO60235 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPRSS11DO60235 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPRSS11DO60235 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPRSS11DO60235 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPRSS11DO60235 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS11DO60235 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS11DO60235 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS11DO60235 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS11DO60235 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS11DO60235 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS11DO60235 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS11DO60235 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS11DO60235 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS11DO60235 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS11DO60235 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPRSS11DO60235 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPRSS11DO60235 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPRSS11DO60235 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPRSS11DO60235 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPRSS11DO60235 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPRSS11DO60235 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPRSS11DO60235 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPRSS11DO60235 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPRSS11DO60235 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPRSS11DO60235 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPRSS11DO60235 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPRSS11DO60235 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPRSS11DO60235 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS11DO60235 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS11DO60235 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS11DO60235 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS11DO60235 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS11DO60235 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS11DO60235 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS11DO60235 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS11DO60235 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS11DO60235 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS11DO60235 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS11DO60235 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS11DO60235 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS11DO60235 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS11DO60235 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS11DO60235 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS11DO60235 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS11DO60235 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS11DO60235 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS11DO60235 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS11DO60235 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS11DO60235 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS11DO60235 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS11DO60235 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS11DO60235 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.9 ms