Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syngr2O55101 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syngr2O55101 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Syngr2O55101 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syngr2O55101 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syngr2O55101 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngr2O55101 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngr2O55101 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngr2O55101 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngr2O55101 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngr2O55101 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngr2O55101 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngr2O55101 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngr2O55101 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngr2O55101 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngr2O55101 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngr2O55101 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngr2O55101 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngr2O55101 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngr2O55101 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr2O55101 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr2O55101 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr2O55101 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr2O55101 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr2O55101 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr2O55101 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngr2O55101 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngr2O55101 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngr2O55101 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngr2O55101 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngr2O55101 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngr2O55101 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngr2O55101 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngr2O55101 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngr2O55101 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngr2O55101 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngr2O55101 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syngr2O55101 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syngr2O55101 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syngr2O55101 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syngr2O55101 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngr2O55101 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms